Порядок тем (блоков) и уроков задают на отдельном экране сортировки курса — а не перетаскиванием на главной странице.
Чтобы изменить порядок уроков и блоков, откройте раздел «Курсы», выберите нужный курс и на его главной странице или во вкладке «Уроки» нажмите «Сортировать». Откроется режим сортировки: у каждого блока и урока появятся стрелки вверх и вниз — расставьте порядок. Выйти из режима можно кнопкой выключения в жёлтой плашке, она вернёт к списку уроков.
Как создавать блоки — в Как разбить курс на блоки?.